وهو جانب مهم مساعد في الأمن البيولوجي ويعتبر ضلع رئيسي من أضلاع مثلث الأمن الحيوي وذلك للوقاية من الأمراض عن طريق تطبيق التحصينات وخاصة الفيروسية منها والتي لا يوجد سبيل آخر للوقاية منها الا عن هذا الطريق والتي لا تنفع معها المضادات الحيوية كما يجب الحرص على اختيار نوع اللقاح المناسب ويعطى في الوقت المناسب من خلال عمل برنامج يغطي جميع الفجوات الزمنية للتربية ولا بد ان نشير هنا إلى أن بعض اللقاحات تعطي مناعة جيدة ولكن تعطي بنفس الوقت تعطي ردات فعل قوية وقاسية .على القطيع وتؤثر على ظهور أمراض أخرى
وهناك طرق عدة لإعطاء اللقاح منها :
- طريق الحقن
- الاستنشاق
- التنقيط بالعين
- والأكثر شيوعا هو الماء.
كما يجب أن يتم اختيار العمر المناسب للقاح ومعرفة قوة اللقاح عند استخدامه, كما يجب عمل اختبارات مصلية من خلال اخذ عينات عشوائية بشكل روتيني لمعرفة مستوى الأجسام المضادة لمعرفة مستوى الأجسام المناعية لدى الطائر، والتوقيت المناسب لإعطاء اللقاح, ونتائج اللقاح. وان تحفظ هذه النتائج في سجلات سهل الوصول إليها والتي ستكون عامل مهم في الحكم عند الإصابة بمرض معين.